Ως συγγενείς ορίζονται οι καρδιοπάθειες με τις οποίες γεννιέται κανείς. Συνηθέστερες συγγενείς καρδιοπάθειες είναι οι διαφόρων ειδών επικοινωνίες, π.χ. μεσοκοιλιακή, μεσοκολπική («τρυπίτσες» δηλαδή στην καρδιά), διαφόρων ειδών στενώσεις, π.χ. ισθμική στένωση, στένωση πνευμονικής ή αορτικής βαλβίδας, όπως και οι κυανωτικές καρδιοπάθειες, π.χ. η τετραλογία Fallot, η μετάθεση των μεγάλων αγγείων, ο αρτηριακός κορμός και άλλες.

Τα συνηθέστερα συμπτώματα που προκαλούν οι συγγενείς καρδιοπάθειες, όταν είναι σημαντικές είναι είτε η δυσκολία στην αναπνοή και η ανεπαρκής πρόσληψη βάρους στα μικρότερα βρέφη ή η κυάνωση, το να είναι δηλαδή το παιδάκι «μπλε» αρχικά γύρω από τα χειλάκια του.

Συνήθως, στην καθεμία απ’ αυτές ακούγεται χαρακτηριστικό φύσημα, το οποίο είναι σε θέση ο παιδίατρος του παιδιού να ακούσει με το στηθοσκόπιο και να στείλει το παιδί για αξιολόγηση, πολλές φορές πριν καν προλάβουν να εμφανιστούν τα συμπτώματα.